新生抗原(Neoantigen)是連接腫瘤基因組和T細胞免疫反應的橋梁,是實現腫瘤精準免疫“診”“療”產品轉化的關鍵。
整合多種方法進行結果的交叉驗證是裕策特有的
新生抗原檢測算法TruNeo?為國內唯一經TESLA驗證
常見新生抗原算法在每個分析階段確定的基因組變異經過篩選后,最后驗證為免疫原性的肽段數量不到10%,裕策生物自主開發的TruNeo?智能機器學習算法,納入新生抗原傳遞與識別的生物途徑多因素,使新生抗原檢測的準確性更高;加入神經網絡深度學習算法優化,經過TESLA 和天梯計劃研究院多年積累,擁有經過實驗驗證的新生抗原陰陽性數據庫、共有新生抗原數據庫,能夠提高預測的肽段數量。
采集外周血驗證PBMC中是否存在新生抗原特異性T細胞。

高通量體外驗證:驗證新生抗原免疫原性,并獲得有親和力的 TCR 的 CDR3 區的序列

用于臨床前研究評估腫瘤新生抗原個性化免疫療法的療效

腫瘤細胞系表達數據庫:CCLE 1,000+
中國人群HLA數據庫:20,000+
腫瘤患者數據庫:ICGC 100,000+/中國人群1,000+
腫瘤高頻新生抗原庫
結腸癌的蛋白質譜數據
錨定殘基數據庫
MHC識別/TAP轉運/蛋白酶裂解數據庫
血液腫瘤融合基因來源的新生抗原庫
TESLA及自有驗證數據
HPV病毒新生抗原庫
AI質譜驗證數據
天梯計劃數據庫及其他自有數據庫

依托龐大的數據庫,深厚的生物信息技術和計算資源平臺,建立國內首個針對新生抗原全類型(I型、II型MHC遞呈,插入缺失、融合來源的新生抗原)的預測平臺

基于TESLA驗證數據優化算法,算法準確性達到全球領先水平

功能模塊不斷優化。建立國內唯一覆蓋腫瘤新生抗原產生過程全部生物學環節的系統算法模型

建立國內首個基于深度學習的新生抗原算法模型
華大智造DNBSEQ-T7
華大智造MGISEQ-2000
NanoString nCounter??FLEX
NanoString GeoMx? Digital Spatial Profiler
安捷倫 NovoCyte? Flow Cytometer
Leica Bond-RX 全自動染片機
Akoya Vectra Polaris? 全自動定量病理成像系統
Dako 全自動免疫組化染色系統
Olink Signature Q100
依托裕策生物的中心實驗室服務平臺,廣大科研工作者將可以在大量臨床樣本中高效地應用nCounter技術以及TIS(Tumor inflammation signature,腫瘤發炎指數)對復雜的腫瘤微環境,細胞信號通路進行深度解析。

PanCancer IO 360?基因表達panel是NanoString開發的一個可檢測770基因表達的Panel,僅供研究使用(RUO),它結合了涉及腫瘤,微環境和癌癥免疫反應之間復雜相互作用的重要部分,可以提供疾病生物學多方面的表征和免疫逃逸的機制的信息。
更高效:770個基因&18個免疫信號通路
更精準: 48個生物學特征譜
更快速: 24h出報告

它來源于默克公司的臨床數據,經過在泛癌中的驗證,可以通過18個基因的GEPs數據預測對PD-1抗體單藥K藥(Pembrolizumab)的反應。
它量化了腫瘤微環境中外周抑制的適應性免疫反應的強度。
裕策生物可提供高通量、多組學和彈性選擇區域的多組學組織原位表達分析服務。
GeoMx? DSP 是 NanoString 最新發布的用于空間生物學研究的技術平臺,可同時實現高參數,多組學,高精度并且同時兼容石蠟樣本(FFPE)、新鮮冷凍樣本、組織微陣列等不同樣本類型。它可以在同一臨床樣本中一次性測定多達 96 個蛋白,又或者1833個 RNA 靶物或者全轉錄組的測定,完美實現多組學研究。

? Leica Bond-RX全自動染片機
? 不依賴于人工染色,穩定性高
? 程序可控,可重復性高

? 多色免疫組化&免疫熒光
? Opal?多標試劑盒
? TSA Plus?信號放大

? 特定組織類型&TMA組織芯片
? Vectra自動化成像

? 人工智能,機器學習
? InForm Tissue Finder?軟件可以結合給予的示例進行數據優化
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